İshakoğlu İsa Bey/Isa Beg Ishaković boszniai szandzsákbég embere volt Ahmed Bey, aki a silahdar (szó szerint: fegyverhordozó, egyébiránt magas rangú oszmán közigazgatási-katonai) címet viselte, s a 15. század második felében emeltette ezt a mecsetet. Amit, a minaretjén gyakran megtelepedő madarakról Gólya mecsetnek neveztek el.
A források szerint 1516-ban már biztosan állt. 1689-ben a nagy osztrák kamu-hadjárat idején lerombolták.
A 18. században építették újjá.
